README

Dieses Repository dient als Online-Anhang der Diplomarbeit "Analyse der
transkriptionellen Regulation von Sekundärmetabolit-Gen-Clustern".

Die Diplomarbeit wurde von Thomas Wolf an der Friedrich-Schiller-Universität
Jena - Fakultät für Mathematik und Informatik und am Leibniz-Institut für
Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie e. V. - Hans-Knöll-Institut -
Forschungsgruppe Systembiologie/Bioinformatik zur Erlangung des akademischen
Grades Diplom-Bioinformatiker erstellt.

Es enthält eine Genomsequenz und die zugehörige Annotation, ein Flatfile der
FunTF-Datenbank, Quellcode von Perl- und R-Programmen, die von Perl erzeugten
Ausgaben in Form von txt-, csv- und fasta-Dateien und diese Readme-Datei.

Um die Programme ausführen zu können, sollte der gesamte Inhalt dieses
Repositories heruntergeladen werden. Es ist wichtig, die Verzeichnisstruktur
nicht zu ändern! Außerdem wird eine aktuelle Perl- beziehungsweise
R-Installation vorausgesetzt.